Tarton yliopisto (UT) perustettiin vuonna 1632. Yliopisto tarjoaa 195 tutkimuspohjaista tutkintoa ja tutkimusohjelmaa molemmissa perus- ja sovelletussa tutkimuksessa. Yliopistolla opiskelee 13 400 opiskelijaa (mukaan lukien n. 1000 kansainvälistä opiskelijaa) neljässä tiedekunnassa (taiteet ja humanistiset tieteet, lääketiede, tiede ja teknologia, yhteiskuntatieteet).

Tarton yliopisto kuuluu maailman top 2 % yliopistoihin, ollen sijalla 314. QS World University -listalla vuonna 2017 ja 301-350 sijoilla Times Higher Education (THE) World University -listalla vuonna 2017. Tarton yliopisto sijoittui myös kolmanneksi QSUniversity -listalla osiossa kasvavien eurooppalaisten ja keski-Aasian yliopistoista (QS EECA University Rankings 2018).

Enemmän kuin puolet Viron tohtorintutkinnoista (122 vuonna 2018), tutkimusjulkaisuista ja kansallisesta tutkimusrahoituksesta keskittyy Tarton yliopistoon. ESI-indeksin (Essential Science Indicators) mukaan Tarton yliopisto kuuluu top 1 % kaikista maailman lainatuimmista yliopistoista tieteellisissä julkaisuissa yhdeksässä tutkimusalueessa: kliininen lääketiede, kasvi- ja eläintiede, kemia, yhteiskuntatiede, ympäristötieteet ja ekologia, molekyylibiologia ja geenitiede, biologia ja biokemia, neurotiede ja käyttäytymistiede, psykiatria ja psykologia. 42 yliopiston tutkijoista kuuluu mailman parhaimpaan 1 %:iin.